内部控制审计是对组织中各类业务和控制进行独立评价，以确定是否遵循公认的方针和程序，是否符合规定和标准，是否有效和经济的使用了资源，是否在实现组织目标。
主要区别：
1.目标不同。内部控制检查是建立相互制约的管理关系，目的是改善经营管理；内部审计是对各种业务进行评价，是否合规。
2.手段不同。内部控制手段主要有环境控制、风险评估、活动控制、信息与沟通、监控等；内部控制审计主要手段是查证、函证、抽样、座谈、调查等。
3.关注点不同。内部控制的关注点是管理流程、制度和岗位约束、制度的有效性、关键岗位等；内部控制审计的关注点是各项指标完成情况，异常财务现象，财务规范性等。
4.对象不同。内部控制的对象是整个企业的各个环节；内部审计是相关环节和财务相关信息。
内部控制检查与内部控制审计的关系：
1.内部控制检查和内部控制审计都是企业内部管理的重要手段，都需要建立相关体系和制度。
2.内部审计检查是内部控制的检验和保证，并为内部控制提出改进意见；完善和健全的内部控制制度是内部控制审计的目的之一。
3.内部控制检查和内部控制审计是相辅相成的关系，互为手段和目标。
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